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RIT科学家成功模拟冠状病毒在人体细胞上的附着形态

​RIT的科学家们发现了有关冠状病毒及其几种变体附着在人体细胞上的方式的新信息。研究人员研究了SARS-CoV-2和alpha、beta和gamma变种,以及在人类和蝙蝠中发现的几种地方性冠状病毒株(endemic strains)。他们发现冠状病毒在两个主要位置捕获人体细胞,并且演变成新的变种,它对人类目标的控制正在收紧。详细的报告发表在《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》

研究人员使用RIT Thomas H. Gosnell 生命科学学院副教授Gregory Babbitt开发的代码来研究冠状病毒如何利用它们的刺突蛋白将自身附着在它们所攻击的宿主细胞上。

“我们在分子动力学领域使用了复杂的计算机模拟来比较 β 冠状病毒蛋白与宿主细胞的第一次相互作用,”研究主导者——RIT校友Patrick Rynkiewicz ’20(生物信息学和计算生物学)、’21 MS(生物信息学)说,“这是病毒刺突蛋白——所谓的受体结合域——与被称为 ACE2 的人类宿主细胞受体之间的相互作用。”

研究人员研究了 SARS-CoV-2 和 alpha、beta 和 gamma 变体,以及在人类和蝙蝠中发现的几种地方性冠状病毒株。作者发现冠状病毒在两个主要位置捕获人体细胞,并且随着它演变成新的变种,它对人类目标的控制正在收紧。

研究报告撰写人,RIT教授André Hudson以及副教授Feng Cui(来自中国)希望这些发现可以帮助指导未来药物的设计,并帮助预测未来的变异如何进化让人类感染。

目前,Babbitt教授现在正在使用他的代码来研究delta变种病毒。

受体模型:

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RIT研究项目再获NSF拨款 继续探索宇宙奥秘

RIT团队一直在NANOGrav(北美纳米赫兹引力波天文台)物理前沿中心(PFC)进行相关研究工作,近日,美国国家科学基金会(NSF)决定继续拨款支持NANOGrav的运营,五年内共将拨款1700万美元,RIT未来五年也将获得703,000美元用于研究。

NANOGrav于2007年10月创立,它已发展成为一个拥有分布在全球的高科技人才智库的合作组织,拥有全球约40家机构共约 200名学生和科学家。

NANOGrav PFC将解决天体物理学中的一个革命性难题:低频引力波的检测和表征。我们最可能探测到低频引力波的方式是通过大质量星系合并形成的超大质量双黑洞;其他低频引力波源还包括宇宙弦、暴胀和其他早期宇宙过程。

RIT团队将在多方面的研究中做出贡献,包括时序管道构建、噪声特性分析和阵列优化。RIT 资助的首席研究员是物理与天文学院的副教授Michael Lam,还有许多其他RIT 教职员工、博士后研究人员和学生等都是NANOGrav的一部分。

RIT物理与天文学院

专门研究激动人心的物理学学科,从亚原子世界的运作到不断膨胀的宇宙!理学士物理课程提供全面的课程,为实验、计算和理论物理学奠定坚实的基础,强调实验室培训和分析问题解决能力的发展。物理专业的学生为从事研究、工业和教学工作以及物理和相关领域的研究生学习做好了充分的准备。物理学士学位的学生还可以在各种专业课程中找到研究生的实习机会,例如医学、法律和商学院。

在研究生阶段,物理与天文学院提供天体物理科学与技术的博士和硕士课程,提供多样化的课程和研究机会,涵盖恒星、星系和河外天体物理学以及广义相对论、引力波天文学领域,以及仪器/检测器的开发。此外,学校还提供涵盖物理领域各个分支学科的通用物理硕士课程,并为学生提供研究和专业选择。

对于希望在此领域深耕的同学,RIT物理与天文学院是你不错的选择,学院还提供四个“五年连读”快速项目可以选择入读!

官网主页:https://www.rit.edu/science/school-physics-and-astronomy

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RIT中国教授杜可团队研究课题登杂志封面

​近日,专门研究微生物科学的RIT中国教授杜可的团队又有好消息传来,其研究团队成员的一份论文被老牌科学期刊《Electrophoresis》收录并作为封面刊登!这份论文中研究员们采用一种创新的观察方法来研究自发荧光水藻的细胞内吞过程,从而为更进一步的科学研究打开了“方便之门”。团队成员中还有来自中国的学生。

这样可喜的结果是如何酝酿出来的呢,要从2018年说起……

2018年10月的一个下午,格兰特-科兰斯基 (Grant Korensky) 走进了杜可教授的办公室。这是杜教授在罗切斯特理工大学(RIT)执教的第一个学期。

格兰特是RIT机械工程专业的学生。在刚迈入大四的第一个学期,他选修了杜教授的一门课 – 热传学。

“教授,我想加入您的科研组,和您一起做研究。”格兰特说道。

在工作中的同学们, 从右至左: 格兰特, 陈新业, 鲍梦迪. 摄影: 张澍焕

“感谢你对我们所研究的课题感兴趣,”杜教授对他的印象很深。这是一个略显羞涩且成绩非常出色的学生,他习惯坐在教室的最后一排,几乎每堂课都会提出很多有趣的想法。


“你对我们的哪一个课题比较感兴趣呢?”杜教授问道。

格兰特仔细思考了一会,却没有一个很好的答案。

“没关系,我们课题组每周五都有例会,你可以先来听听我们目前正在进行的研究项目,然后你再和我们聊一聊你所感兴趣的研究领域。”杜教授说道。

格兰特很快就找到了他自己想研究的课题 – 莱氏衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)的应用。早在1939年,德国科学家Hans Gaffron发现,在特定的情况下, 这种能够自发荧光的水藻可以产生氢气。由此,很多能源公司都投入了巨额资金来研究这种可再生能源。近些年,随着分子生物学的不断进步,小小的莱氏衣藻还在基因转化、进化,和疫苗等研究领域扮演着重要的角色。

然而,一个困扰科学家很久的问题是,水藻的生存环境中存在的细菌会侵害水藻的细胞膜, 从而影响水藻的健康和产能效率。格兰特和博士生陈新业首先想到一个方案:利用微流控芯片来分离水藻和细菌。他们采用微加工的方法制造出一种小巧而轻便的微流控芯片(Nano-Sieve)。在不同的流速下,这种的芯片内部的微通道可以发生不同的形变,将水藻细胞限制在芯片内,同时过滤掉体积较小的细菌。为了证明水藻细胞在微流控芯片内能够稳定生存,他们用激光光谱仪测试并分析水藻细胞的自荧光信号。难以置信的是,即使激光持续激发水藻细胞长达250秒,水藻的自荧光信号并没有明显下降。基于这样的测试结果,他们随即想到了用水藻稳定持续的自荧光特性结合超分辨显微镜来研究细胞的内吞过程,为细胞如何消化”外来入侵物”提供线索

很快, 一篇由格兰特, 陈新业, 鲍梦迪等人撰写的论文被投到了老牌杂志《Electrophoresis》上。仅一个月的时间,文章顺利发表并被选为当期的封面故事。

当期《Electrophoresis》封面,封面设计: 何文榕 (RIT)

本月,格兰特即将完成自己全部的本科课程。他将带着自己的新封面和近乎全A的成绩,开始自己的博士学术生涯。

更多关于杜可实验室的科研成果和动态请登陆: https://www.3natrit.com/

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RIT与顶尖技术公司L3Harris建立合作伙伴关系

RIT已与美国顶尖技术公司、国防部承包商L3Harris建立了新的行业合作伙伴关系,共同开发量子技术,探索通信、传感和计算的潜在用途。

“量子动力是L3Harris公司锐意进发的领域,并且我们认为量子研究将帮助我们拓展客户,” L3Harris量子解决方案集团的科学家Tim Burt说,“虽然我们在L3Harris本身内部拥有优秀的科学家和工程师,但与该领域的学者(如RIT的学者们)合作可以带来很多好处。我们希望能够更深入地学习这项技术。”

量子应用领域包括太阳能电池、天气预报、密码分析、石油探测、金融领域、搜索服务、人工智能等等,量子计算已经成为很多巨头公司的重要发展方向。

这次合作给RIT的首次资助金额为50,000美元,针对更大、更专门的项目。这次RIT和L3Harris的项目合作伙伴包括RIT物理与天文学学院的副教授Edwin Hach和助理教授Gregory Howland, 还将吸引更多RIT的学生们参与进来,比如物理和微系统工程的硕士和博士研究生们。

RIT一直为推进量子领域的发展而努力,纵使今年受到疫情的影响,我校仍启动召开了线上量子研讨会,邀请全球量子研究专家和行业领导者一同讨论和发表演讲,让越来越多人参与到这个科技最前沿的事业中来。

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RIT为改善老年人生活质量的研究团队获奖

RIT的教授研究团队(左起)David Borkholder,Adam Smith,Linwei Wang和Caroline Easton获得了NAM的首批Catalyst奖金,他们的研究旨在改善人口老龄化的医疗保健,生活质量和寿命。